Der Zootzensee liegt im Norden Brandenburgs und ist Teil der Rheinsberger Seenplatte. Der buchtenreiche und früher deutlich größere See bedeckt eine Fläche von 167 ha. Er ist bis zu 21 m tief. Es bestehen schiffbare Verbindungen in westlicher Richtung über den Repenter Kanal zum Großen Zechliner See und in östlicher über den Zootzenkanal zum Tietzowsee.